在有机合成中，含有2个或多个官能团的分子，为使其中某个官能团免遭反应的破坏，常用某种试剂先将其保护，待反应完成后再脱去保护剂，最常见的是对羟基、氨基以及氨基的保护，保护试剂的种类很多，每一种保护试剂均有与之对应的脱保护条件，常见的保护基有Boc-、Fmoc-、Mom-、Sem-、Thp-、Pht-等，广泛用于药物分子合成和全合成中。